IDEハードディスクの場合、設定がPIO転送設定になっている場合があります。ハードディスクとマザーボードがDMA転送に対応しているので有れば、以下のコマンドで状態を調べてDMA転送モード設定にしてください。
# hdparm -t -d /dev/hda
このコマンドで、DMAがOFFの場合は、
# hdparm -t -d 1 /dev/hda
これで、DMAがONになるはずです。エラーが出力されずアクセスが早くなった場合は、/etc/rc.d/rc.localにこのコマンドを追加してください。再起動後も有効になるはずです。
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